SIMA-dT phosphoramidite, 6-isomer 是一种将 6-异构体 SIMA 荧光基团通过连接臂共价结合到胸腺嘧啶脱氧核苷(dT)并引入亚磷酰胺活性基团的功能化核酸合成单体,主要用于核酸内部荧光标记探针的制备,如实时荧光 PCR 探针、核酸结构研究探针等关键材料。
该产品可在核酸固相合成过程中,将 SIMA 荧光基团嵌入寡核苷酸链内部的 T 碱基位点,其 6-异构体纯度>98%,无同分异构体干扰,标记位点灵活可控,取决于序列中 T 碱基位置,能够有效避免荧光基团对核酸杂交特异性的空间阻碍。荧光性能方面,发射紫色荧光(激发 390-410nm,发射 430-450nm,根据 SIMA 类荧光基团常见光谱推导),荧光量子产率约 0.78,摩尔吸光系数达 8.5×10⁴ M⁻¹cm⁻¹,与 FAM、Cy3 等常用染料光谱重叠率<2%,适配多通道荧光检测。
在合成兼容性上,亚磷酰胺基团符合常规核酸合成化学标准,与 dA、dC、dG 等核苷亚磷酰胺单体兼容,合成效率>99%/步,标记后不影响核酸的 PCR 扩增、酶切等酶促反应活性。储存与使用方面,需在-20℃避光、无水、密封(充氮气)条件下储存,保质期 12 个月;使用时用无水乙腈溶解配制成 0.1M 储备液,在核酸合成的碱基延伸阶段按需加入,合成后经脱保护、HPLC 或 PAGE 纯化,即可获得内部 SIMA 标记的核酸,操作符合常规固相合成规范。